船上安全作業
中運透過人員安全、貨物安全、航行安全及環境安全四個面向來落實船隊管理，船上安全作業依照ISM程序進行管理，除嚴格遵守各項國際公約，並透過教育訓練以提升船隊安全意識，於船舶發生緊急情況或事故時，成立緊急應變小組，負責指揮救護與善後處理，分析缺失、虛驚與事故之原因，提出改善對策，確保船舶適航、適貨和航行安全。
資訊系統架構與安全
中運資訊系統利用中運官網、ERP、中運CSR網站、海運提單系統、洽租船平台、EZoMe及中鋼集團網路與外界溝通聯繫。高階主管更可利用決策支援結合系統隨時掌握最新資訊，如船舶動態、海運市場指數、攬運貨量統計、會計月報查詢、人事資料查詢及租船作業電子商務平台等。
中運因應業務需求，陸續增加IT設備支出，優化軟硬體設施，在兼顧效率與安全防護考量下，提升資訊控管能力。為確保資訊系統安全，中運採行下列措施：
作業程序標準化
已制定「資訊系統之開發與資訊安全管理程序書」，依標準作業程序，避免資訊系統未經授權擅遭存取或使用，含括網域與ERP帳號管理、軟體安裝、網路使用、檔案存取、外部連線、資料備份、復原與銷毀、防止駭客、病毒入侵及破壞、機房管理、帳號與存取權限之取消與資訊安全保密，並進行網路偵測系統、裝設防火牆防止非法入侵、破壞或竊取資料、裝設掃毒軟體，定期掃毒，以提供使用者更安全的網頁瀏覽環境。
落實教育訓練與定期演練
加強全體員工的資安意識，透過資安防護、演練與弱點偵測的加強，以確保企業能正常運作與資料的保全。2020年舉辦資安訓練共60人次95小時，並於對辦公室同仁實施「電子郵件社交工程演練」測試，對未通過測試的同仁加強教育訓練。
強化演練機制
強化防災、資安、監控、通報機制、異常管理，並建置異地備援機制與還原演練。
資安聯防
結合中鋼集團資訊雲端資訊系統，確認各項作業符合資訊安全與法規需求，使資訊更加迅速與透明，增加集團之整體綜效。
維護關鍵系統，加強資訊抵禦能力
持續導入伺服器虛擬化建置，透過減少實體伺服器數量，可達環保節能與減低維護成本的成效。
船上資訊安全
IMO建議2021年起船旗國於此後第一次DOC年度驗證，確認完成將網路風險管理納入公司安全管理系統(SMS)。中運依照網路風險管理五要素-識別、保護、偵測、回應、回復之作業程序進行保護措施並持續改善。
船舶保全工作
本公司之船舶保全政策，持續遵循國際船舶與港口設施保全章程 (ISPS)，執行船舶保全計劃，確保船員、其他雇員、訪客、船舶及貨物之安全，避免遭受恐怖份子，海盜或其他犯罪行為的攻擊，並不定期通告ReCAAP(亞洲區最新海盜週報)。詳細規範船舶保全規劃、保全演習及訓練項目。於到港前召開保安會議，透過艙門上鎖、巡邏、照明、通訊及艙口人員管制措施避免偷竊及偷渡事件，並定期實施各項緊急狀況應變演練，以維護安全。
船上維護保養及物料配件管理
船上設備及系統保持良好，才能維持船舶適航性。中運以風險管理方式為出發點，採定期檢查方式，透過定期維護保養計劃系統，依照保養計畫進行，並查核輪機管理是否落實執行，以有效降低船舶設備故障率及檢視航修費用，並定期安排進塢大修。此外，為鼓勵船上同仁進行設備自行檢修，2020年修訂自修辦法，提高自修獎金，不但可讓船員增加收入，同時也可以藉由自修提升船員自修能力。
船舶動態掌握
除了平日午報系統，各專輪於每日航行資料發送至雲端伺服器上儲存後發送至公司外，可透過衛星AIS船舶自動識別系統使公司能即時掌握船舶動態位置並適時給予船上協助。
目前中運進行「船舶動態資訊系統」開發，可於網路上即時掌握船舶最新動態資訊，該系統將串接中鋼電子商務系統MAT3 船運資料、存取各專輪所發送的航行資訊、並擷取運用Marine Traffic、海象、氣象等相關資訊，包括船隊基本資料、運務狀態、裝載貨物資訊、裝貨及卸貨港之船期排程(ETA、ETB、ETD)、船舶位置與航線軌跡、油耗紀錄等，並整合中鋼及中龍原料碼頭卸貨狀態及排船計劃，系統亦可定期蒐集上述各項船舶數據，可作為管理者決策、分析、規劃及預測等重要資訊工具。後續系統將朝向船舶業務資料豐富化及視覺化之基礎，串接「公司船期表、在船船員、聯絡資訊及船隊塢修時程」等重要資訊，並提升船隊在重要港口的「船位更新及時性」。
貨物運輸安全管理
本公司分別於2020年2月及4月完成船東互保(P&I)責任險以及船體險的年度投保作業。
若有貨損情況發生，船長會立即依據安全管理系統(SMS)之規定，採取適當行動以避免貨損擴大，並立即以衛星電話或衛星通訊將第一手訊息告知辦公室人員。經立即聯繫船東互保協會(P&I)，運用其全世界之通訊聯絡網，適時指派當地公證人登輪，與貨主之保險公司聯合調查事故發生原因、損害範圍等等，並向船長蒐集相關文件以及提供可能之善後建議，以利後續索賠協商順利完成。
本公司於貨物裝載時遵守貨物運輸相關法規，確保船舶對該貨物適於裝載，依照配艙、繫固標準作業程序並監測及記錄，避免貨物缺損。2020年本公司自有成品船運均無超過自付額之貨損紀錄。
航行安全
中運的重要運務之一是去西澳載運鐵礦砂原料回台灣，去回程最經濟航程均會經過西南太平洋西里伯斯海及蘇祿海高風險海域，考量船員生命無價，即使增加偏航成本也要避開海盜風險。自2017年起經過此危險海域均特別注意，若有危險升高情勢，將依船務處指示偏航。
此外，為預防氣候劇烈變化所造成的惡劣海象，透過與氣象軟體公司合作，除定期提供船舶定位與氣象預報服務供船岸雙方參考外，航程中天候狀況的變化亦可透過軟體模擬出最佳航路規劃，協助船隊及早採取措施遠離惡劣海象以確保航行安全。
